Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Eci3Q78JN3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Eci3Q78JN3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Eci3Q78JN3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms