Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usmg5Q78IK2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usmg5Q78IK2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Usmg5Q78IK2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usmg5Q78IK2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usmg5Q78IK2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usmg5Q78IK2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usmg5Q78IK2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usmg5Q78IK2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms