Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Sned1Q70E20 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sned1Q70E20 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sned1Q70E20 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sned1Q70E20 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sned1Q70E20 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sned1Q70E20 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sned1Q70E20 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sned1Q70E20 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sned1Q70E20 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sned1Q70E20 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sned1Q70E20 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sned1Q70E20 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sned1Q70E20 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sned1Q70E20 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sned1Q70E20 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sned1Q70E20 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sned1Q70E20 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sned1Q70E20 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sned1Q70E20 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms