Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Topbp1Q6ZQF0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Topbp1Q6ZQF0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Topbp1Q6ZQF0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Topbp1Q6ZQF0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Topbp1Q6ZQF0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Topbp1Q6ZQF0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Topbp1Q6ZQF0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Topbp1Q6ZQF0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Topbp1Q6ZQF0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Topbp1Q6ZQF0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Topbp1Q6ZQF0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Topbp1Q6ZQF0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Topbp1Q6ZQF0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Topbp1Q6ZQF0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Topbp1Q6ZQF0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Topbp1Q6ZQF0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Topbp1Q6ZQF0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Topbp1Q6ZQF0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms