Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ58

Larp1, La-related protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1Q6ZQ58 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Larp1Q6ZQ58 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Larp1Q6ZQ58 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Larp1Q6ZQ58 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Larp1Q6ZQ58 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Larp1Q6ZQ58 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Larp1Q6ZQ58 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Larp1Q6ZQ58 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Larp1Q6ZQ58 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms