Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NinlQ6ZQ12 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NinlQ6ZQ12 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
NinlQ6ZQ12 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NinlQ6ZQ12 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NinlQ6ZQ12 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
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