Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zc3h4Q6ZPZ3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zc3h4Q6ZPZ3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Zc3h4Q6ZPZ3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms