Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ube2oQ6ZPJ3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube2oQ6ZPJ3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms