Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-M2Q6W9L1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-M2Q6W9L1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-M2Q6W9L1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms