Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt9Q6RHW0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt9Q6RHW0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt9Q6RHW0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt9Q6RHW0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms