Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNU9

Tlr12, Toll-like receptor 12, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr12Q6QNU9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr12Q6QNU9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr12Q6QNU9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr12Q6QNU9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Tlr12Q6QNU9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms