Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIX5

Rhbdf1, Inactive rhomboid protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdf1Q6PIX5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rhbdf1Q6PIX5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhbdf1Q6PIX5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rhbdf1Q6PIX5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhbdf1Q6PIX5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhbdf1Q6PIX5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhbdf1Q6PIX5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms