Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gramd2bQ6PEM6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gramd2bQ6PEM6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gramd2bQ6PEM6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gramd2bQ6PEM6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms