Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp49Q6P9L4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp49Q6P9L4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp49Q6P9L4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms