Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tsen2Q6P7W5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tsen2Q6P7W5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tsen2Q6P7W5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tsen2Q6P7W5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tsen2Q6P7W5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms