Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hdac10Q6P3E7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hdac10Q6P3E7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac10Q6P3E7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms