Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP1

Zranb3, DNA annealing helicase and endonuclease ZRANB3, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zranb3Q6NZP1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zranb3Q6NZP1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zranb3Q6NZP1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zranb3Q6NZP1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zranb3Q6NZP1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Zranb3Q6NZP1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zranb3Q6NZP1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zranb3Q6NZP1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Zranb3Q6NZP1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zranb3Q6NZP1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zranb3Q6NZP1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zranb3Q6NZP1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zranb3Q6NZP1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Zranb3Q6NZP1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Zranb3Q6NZP1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zranb3Q6NZP1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zranb3Q6NZP1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zranb3Q6NZP1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zranb3Q6NZP1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zranb3Q6NZP1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Zranb3Q6NZP1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zranb3Q6NZP1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zranb3Q6NZP1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zranb3Q6NZP1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zranb3Q6NZP1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zranb3Q6NZP1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zranb3Q6NZP1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zranb3Q6NZP1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zranb3Q6NZP1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zranb3Q6NZP1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zranb3Q6NZP1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zranb3Q6NZP1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zranb3Q6NZP1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms