Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rad17Q6NXW6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rad17Q6NXW6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rad17Q6NXW6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rad17Q6NXW6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms