Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc3bQ6NWW9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc3bQ6NWW9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Fndc3bQ6NWW9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fndc3bQ6NWW9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fndc3bQ6NWW9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms