Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt40Q6IFX3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt40Q6IFX3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt40Q6IFX3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt40Q6IFX3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Krt40Q6IFX3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Krt40Q6IFX3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Krt40Q6IFX3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Krt40Q6IFX3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Krt40Q6IFX3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt40Q6IFX3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt40Q6IFX3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Krt40Q6IFX3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt40Q6IFX3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
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