Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Edrf1Q6GQV7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Edrf1Q6GQV7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Edrf1Q6GQV7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Edrf1Q6GQV7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Edrf1Q6GQV7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms