Protein–RNA interactions for Protein: Q6A039

Tbc1d12, TBC1 domain family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d12Q6A039 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d12Q6A039 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbc1d12Q6A039 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d12Q6A039 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbc1d12Q6A039 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d12Q6A039 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d12Q6A039 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d12Q6A039 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d12Q6A039 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tbc1d12Q6A039 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d12Q6A039 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tbc1d12Q6A039 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d12Q6A039 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d12Q6A039 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d12Q6A039 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tbc1d12Q6A039 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbc1d12Q6A039 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbc1d12Q6A039 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tbc1d12Q6A039 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms