Protein–RNA interactions for Protein: Q66JX5

Fgfr1op, FGFR1 oncogene partner, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1opQ66JX5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fgfr1opQ66JX5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fgfr1opQ66JX5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fgfr1opQ66JX5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Fgfr1opQ66JX5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgfr1opQ66JX5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgfr1opQ66JX5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fgfr1opQ66JX5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgfr1opQ66JX5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgfr1opQ66JX5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgfr1opQ66JX5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fgfr1opQ66JX5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgfr1opQ66JX5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgfr1opQ66JX5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fgfr1opQ66JX5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgfr1opQ66JX5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fgfr1opQ66JX5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms