Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2a3Q64518 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp2a3Q64518 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2a3Q64518 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2a3Q64518 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.5 ms