Protein–RNA interactions for Protein: Q64445

Cox8a, Cytochrome c oxidase subunit 8A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8aQ64445 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox8aQ64445 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cox8aQ64445 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cox8aQ64445 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cox8aQ64445 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cox8aQ64445 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cox8aQ64445 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms