Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Surf4Q64310 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Surf4Q64310 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Surf4Q64310 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms