Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ifit1Q64282 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ifit1Q64282 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ifit1Q64282 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ifit1Q64282 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms