Protein–RNA interactions for Protein: Q640M6

Gdpd5, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd5Q640M6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdpd5Q640M6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdpd5Q640M6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gdpd5Q640M6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdpd5Q640M6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdpd5Q640M6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpd5Q640M6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms