Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vat1Q62465 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vat1Q62465 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vat1Q62465 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vat1Q62465 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vat1Q62465 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vat1Q62465 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vat1Q62465 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms