Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ss18Q62280 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Ss18Q62280 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ss18Q62280 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ss18Q62280 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ss18Q62280 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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