Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Six2Q62232 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Six2Q62232 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Six2Q62232 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Six2Q62232 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Six2Q62232 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Six2Q62232 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Six2Q62232 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Six2Q62232 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Six2Q62232 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Six2Q62232 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Six2Q62232 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Six2Q62232 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Six2Q62232 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Six2Q62232 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms