Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Six1Q62231 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Six1Q62231 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Six1Q62231 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Six1Q62231 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Six1Q62231 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Six1Q62231 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Six1Q62231 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Six1Q62231 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Six1Q62231 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Six1Q62231 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Six1Q62231 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Six1Q62231 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Six1Q62231 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Six1Q62231 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Six1Q62231 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six1Q62231 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Six1Q62231 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Six1Q62231 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Six1Q62231 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Six1Q62231 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Six1Q62231 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Six1Q62231 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six1Q62231 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Six1Q62231 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six1Q62231 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Six1Q62231 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Six1Q62231 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Six1Q62231 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Six1Q62231 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Six1Q62231 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms