Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema5aQ62217 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema5aQ62217 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sema5aQ62217 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema5aQ62217 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms