Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3bQ62141 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sin3bQ62141 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sin3bQ62141 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sin3bQ62141 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Sin3bQ62141 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms