Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctr9Q62018 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctr9Q62018 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ctr9Q62018 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctr9Q62018 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms