Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fscn1Q61553 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fscn1Q61553 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fscn1Q61553 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fscn1Q61553 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fscn1Q61553 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fscn1Q61553 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fscn1Q61553 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fscn1Q61553 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fscn1Q61553 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms