Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cacna1eQ61290 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna1eQ61290 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1eQ61290 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1eQ61290 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms