Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gata6Q61169 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gata6Q61169 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gata6Q61169 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gata6Q61169 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gata6Q61169 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gata6Q61169 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata6Q61169 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms