Protein–RNA interactions for Protein: Q61093

Cybb, Cytochrome b-245 heavy chain, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CybbQ61093 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CybbQ61093 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CybbQ61093 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CybbQ61093 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CybbQ61093 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CybbQ61093 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CybbQ61093 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CybbQ61093 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CybbQ61093 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CybbQ61093 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CybbQ61093 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CybbQ61093 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CybbQ61093 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CybbQ61093 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CybbQ61093 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CybbQ61093 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CybbQ61093 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CybbQ61093 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CybbQ61093 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CybbQ61093 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CybbQ61093 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CybbQ61093 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CybbQ61093 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CybbQ61093 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CybbQ61093 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CybbQ61093 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CybbQ61093 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CybbQ61093 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CybbQ61093 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms