Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Laptm4aQ60961 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Laptm4aQ60961 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Laptm4aQ60961 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Laptm4aQ60961 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Laptm4aQ60961 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Laptm4aQ60961 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Laptm4aQ60961 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Laptm4aQ60961 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Laptm4aQ60961 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Laptm4aQ60961 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms