Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vdac1Q60932 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vdac1Q60932 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vdac1Q60932 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms