Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a4Q60857 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a4Q60857 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc6a4Q60857 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a4Q60857 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms