Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnfrsf8Q60846 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnfrsf8Q60846 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms