Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stxbp3Q60770 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stxbp3Q60770 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stxbp3Q60770 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms