Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Atf3Q60765 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Atf3Q60765 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Atf3Q60765 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Atf3Q60765 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Atf3Q60765 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Atf3Q60765 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Atf3Q60765 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Atf3Q60765 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Atf3Q60765 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Atf3Q60765 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Atf3Q60765 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Atf3Q60765 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Atf3Q60765 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Atf3Q60765 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Atf3Q60765 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Atf3Q60765 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Atf3Q60765 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Atf3Q60765 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Atf3Q60765 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Atf3Q60765 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Atf3Q60765 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Atf3Q60765 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Atf3Q60765 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Atf3Q60765 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Atf3Q60765 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Atf3Q60765 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Atf3Q60765 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Atf3Q60765 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Atf3Q60765 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Atf3Q60765 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms