Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
P4ha1Q60715 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4ha1Q60715 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P4ha1Q60715 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4ha1Q60715 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms