Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxd4Q60688 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxd4Q60688 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd4Q60688 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd4Q60688 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms