Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
NacadQ5SWP3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
NacadQ5SWP3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
NacadQ5SWP3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
NacadQ5SWP3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
NacadQ5SWP3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
NacadQ5SWP3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
NacadQ5SWP3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
NacadQ5SWP3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
NacadQ5SWP3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
NacadQ5SWP3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
NacadQ5SWP3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
NacadQ5SWP3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
NacadQ5SWP3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
NacadQ5SWP3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
NacadQ5SWP3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
NacadQ5SWP3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
NacadQ5SWP3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
NacadQ5SWP3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
NacadQ5SWP3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC43■■■■■ 4.47
NacadQ5SWP3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
NacadQ5SWP3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
NacadQ5SWP3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC42.99■■■■■ 4.47
NacadQ5SWP3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
NacadQ5SWP3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
NacadQ5SWP3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
NacadQ5SWP3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
NacadQ5SWP3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
NacadQ5SWP3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
NacadQ5SWP3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
NacadQ5SWP3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
NacadQ5SWP3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
NacadQ5SWP3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
NacadQ5SWP3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
NacadQ5SWP3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC42.93■■■■■ 4.46
NacadQ5SWP3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
NacadQ5SWP3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
NacadQ5SWP3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
NacadQ5SWP3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
NacadQ5SWP3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
NacadQ5SWP3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
NacadQ5SWP3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
NacadQ5SWP3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
NacadQ5SWP3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.46
NacadQ5SWP3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
NacadQ5SWP3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
NacadQ5SWP3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
NacadQ5SWP3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NacadQ5SWP3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
NacadQ5SWP3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
NacadQ5SWP3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
NacadQ5SWP3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
NacadQ5SWP3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NacadQ5SWP3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
NacadQ5SWP3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
NacadQ5SWP3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
NacadQ5SWP3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
NacadQ5SWP3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
NacadQ5SWP3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
NacadQ5SWP3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.44
NacadQ5SWP3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
NacadQ5SWP3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
NacadQ5SWP3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
NacadQ5SWP3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
NacadQ5SWP3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
NacadQ5SWP3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
NacadQ5SWP3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
NacadQ5SWP3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
NacadQ5SWP3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
NacadQ5SWP3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
NacadQ5SWP3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
NacadQ5SWP3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
NacadQ5SWP3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
NacadQ5SWP3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
NacadQ5SWP3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
NacadQ5SWP3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
NacadQ5SWP3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
NacadQ5SWP3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC42.73■■■■■ 4.43
NacadQ5SWP3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
NacadQ5SWP3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
NacadQ5SWP3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
NacadQ5SWP3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
NacadQ5SWP3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
NacadQ5SWP3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.43
NacadQ5SWP3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
NacadQ5SWP3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
NacadQ5SWP3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
NacadQ5SWP3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NacadQ5SWP3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NacadQ5SWP3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NacadQ5SWP3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NacadQ5SWP3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
NacadQ5SWP3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
NacadQ5SWP3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
NacadQ5SWP3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
NacadQ5SWP3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
NacadQ5SWP3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
NacadQ5SWP3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
NacadQ5SWP3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
NacadQ5SWP3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms