Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc42Q5SV66 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc42Q5SV66 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc42Q5SV66 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc42Q5SV66 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms