Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sco1Q5SUC9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sco1Q5SUC9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sco1Q5SUC9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms